Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx28Q9CWT6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms