Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms