Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms