Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1bQ9CSU0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1bQ9CSU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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