Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Filip1Q9CS72 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Filip1Q9CS72 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms