Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska2Q9CR46 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms