Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd9Q9CR00 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms