Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms