Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ykt6Q9CQW1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms