Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms