Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Chchd5Q9CQP3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms