Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Mrpl35Q9CQL6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Mrpl35Q9CQL6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl35Q9CQL6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl35Q9CQL6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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