Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms