Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl11Q9CQF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms