Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ergic3Q9CQE7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ergic3Q9CQE7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms