Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms