Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CQC3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CQC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms