Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpa3Q9CQ71 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms