Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ncbp2Q9CQ49 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms