Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rpl17Q9CPR4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms