Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms