Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rims1Q99NE5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms