Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atoh8Q99NA2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms