Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd1Q99MV1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms