Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms