Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms