Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tm2d1Q99MB3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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