Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprtQ99M80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprtQ99M80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms