Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins4Q99LZ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms