Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99KU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q99KU6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99KU6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99KU6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99KU6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms