Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf19Q99KP6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms