Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dok4Q99KE3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms