Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxp3Q99JB6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxp3Q99JB6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms