Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms