Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms