Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrm1Q99J25 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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