Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ctu1Q99J10 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ctu1Q99J10 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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