Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med1Q925J9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms