Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms