Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrif1Q923B3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrif1Q923B3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms