Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb6Q922F4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms