Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l1Q920A7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms