Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smarca5Q91ZW3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms