Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms