Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms