Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms