Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Klhdc3Q8VEM9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klhdc3Q8VEM9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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