Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul7Q8VE73 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul7Q8VE73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cul7Q8VE73 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul7Q8VE73 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms