Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1aQ8VDS4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1aQ8VDS4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1aQ8VDS4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms