Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc92Q8VDN4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms